Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tjp1P39447 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms