Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddit3P35639 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddit3P35639 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddit3P35639 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ddit3P35639 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddit3P35639 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddit3P35639 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddit3P35639 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddit3P35639 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddit3P35639 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ddit3P35639 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddit3P35639 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ddit3P35639 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ddit3P35639 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ddit3P35639 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddit3P35639 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddit3P35639 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddit3P35639 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddit3P35639 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddit3P35639 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddit3P35639 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddit3P35639 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ddit3P35639 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddit3P35639 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddit3P35639 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ddit3P35639 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ddit3P35639 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddit3P35639 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddit3P35639 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ddit3P35639 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ddit3P35639 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddit3P35639 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddit3P35639 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddit3P35639 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ddit3P35639 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ddit3P35639 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms