Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sftpa1P35242 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sftpa1P35242 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms