Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Olfr46-202ENSMUST00000211771 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Arl14ep-202ENSMUST00000093883 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Gm13732-201ENSMUST00000117753 535 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Vmn1r-ps132-201ENSMUST00000120434 892 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Cfhr3-201ENSMUST00000170441 1022 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Vmn1r226-201ENSMUST00000061756 897 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxa2P31245 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms