Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PtprmP28828 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PtprmP28828 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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