Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxrgP28705 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxrgP28705 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms