Protein–RNA interactions for Protein: P28659

Celf1, CUGBP Elav-like family member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf1P28659 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Celf1P28659 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Celf1P28659 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Celf1P28659 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Celf1P28659 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Celf1P28659 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Celf1P28659 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Celf1P28659 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Celf1P28659 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Celf1P28659 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Celf1P28659 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Celf1P28659 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Celf1P28659 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Celf1P28659 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Celf1P28659 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Celf1P28659 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Celf1P28659 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Celf1P28659 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Celf1P28659 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Celf1P28659 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Celf1P28659 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Celf1P28659 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Celf1P28659 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Celf1P28659 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Celf1P28659 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Celf1P28659 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Celf1P28659 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Celf1P28659 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Celf1P28659 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Celf1P28659 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Celf1P28659 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Celf1P28659 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Celf1P28659 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms