Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxd10P28359 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxd10P28359 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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