Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2afxP27661 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2afxP27661 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2afxP27661 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2afxP27661 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2afxP27661 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
H2afxP27661 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2afxP27661 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2afxP27661 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
H2afxP27661 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
H2afxP27661 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms