Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Xrcc5P27641 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Xrcc5P27641 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Xrcc5P27641 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Xrcc5P27641 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Xrcc5P27641 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Xrcc5P27641 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Xrcc5P27641 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Xrcc5P27641 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Xrcc5P27641 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Xrcc5P27641 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Xrcc5P27641 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Xrcc5P27641 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Xrcc5P27641 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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