Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
U2af2P26369 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
U2af2P26369 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
U2af2P26369 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms