Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
NdnP25233 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
NdnP25233 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
NdnP25233 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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