Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

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Length 683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PrkchP23298 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
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