Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Clk1P22518 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms