Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Tap1P21958 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Tap1P21958 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Tap1P21958 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Tap1P21958 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Tap1P21958 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Tap1P21958 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tap1P21958 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Tap1P21958 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tap1P21958 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tap1P21958 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tap1P21958 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Tap1P21958 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Tap1P21958 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms