Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fcer1aP20489 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
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