Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
Gata1P17679 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gata1P17679 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Gata1P17679 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms