Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Sptan1P16546 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Pex3-207ENSMUST00000170376 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Sptan1P16546 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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