Protein–RNA interactions for Protein: P15530

Cd79b, B-cell antigen receptor complex-associated protein beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd79bP15530 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd79bP15530 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd79bP15530 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd79bP15530 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd79bP15530 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd79bP15530 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd79bP15530 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd79bP15530 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd79bP15530 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd79bP15530 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cd79bP15530 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cd79bP15530 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms