Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb7P09024 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms