Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Spta1P08032 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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