Protein–RNA interactions for Protein: P04444

Hbb-bh1, Hemoglobin subunit beta-H1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh1P04444 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh1P04444 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh1P04444 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh1P04444 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh1P04444 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh1P04444 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh1P04444 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh1P04444 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh1P04444 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh1P04444 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh1P04444 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh1P04444 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh1P04444 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh1P04444 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh1P04444 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh1P04444 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh1P04444 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh1P04444 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh1P04444 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh1P04444 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh1P04444 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Hbb-bh1P04444 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Hbb-bh1P04444 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms