Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tgfb1P04202 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms