Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
P01649 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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P01649 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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P01649 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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P01649 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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P01649 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P01649 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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