Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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CcnkO88874 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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CcnkO88874 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
CcnkO88874 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms