Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

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Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Copb2O55029 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Copb2O55029 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Copb2O55029 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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Copb2O55029 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Copb2O55029 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Copb2O55029 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Copb2O55029 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copb2O55029 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Copb2O55029 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copb2O55029 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Copb2O55029 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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