Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rdh16O54909 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms