Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Csnk2a2O54833 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms