Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DffaO54786 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DffaO54786 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
DffaO54786 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DffaO54786 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DffaO54786 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DffaO54786 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DffaO54786 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
DffaO54786 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
DffaO54786 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms