Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Psmb10O35955 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Psmb10O35955 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
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Psmb10O35955 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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Psmb10O35955 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Psmb10O35955 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
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Psmb10O35955 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Psmb10O35955 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms