Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek2O35942 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nek2O35942 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nek2O35942 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Nek2O35942 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms