Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Sp100O35892 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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Sp100O35892 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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Sp100O35892 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Sp100O35892 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Sp100O35892 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Sp100O35892 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Sp100O35892 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Sp100O35892 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Sp100O35892 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Sp100O35892 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sp100O35892 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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Sp100O35892 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
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