Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Atf6bO35451 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Atf6bO35451 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms