Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
H2-Q1O19441 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-Q1O19441 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-Q1O19441 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
H2-Q1O19441 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1O19441 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
H2-Q1O19441 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms