Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Stat1-205ENSMUST00000186574 2834 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ccdc116-202ENSMUST00000115709 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Irf2-201ENSMUST00000034041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Rorc-201ENSMUST00000029795 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ptrh2-202ENSMUST00000108022 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm9860-201ENSMUST00000211426 3653 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Bbs7-202ENSMUST00000108155 2437 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Slc28a1-201ENSMUST00000026820 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 D130017N08Rik-202ENSMUST00000180951 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Wdhd1-201ENSMUST00000111790 2962 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Lamp2-202ENSMUST00000061755 3604 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Apol11b-204ENSMUST00000181467 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PrkcshO08795 Man2c1-211ENSMUST00000160147 3820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms