Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MttpO08601 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MttpO08601 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MttpO08601 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MttpO08601 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
MttpO08601 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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MttpO08601 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
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MttpO08601 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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MttpO08601 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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MttpO08601 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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MttpO08601 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
MttpO08601 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
MttpO08601 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
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