Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sec22bO08547 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms