Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm379J3QQ19 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms