Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Smim18J3QNP2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Smim18J3QNP2 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Smim18J3QNP2 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Smim18J3QNP2 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Smim18J3QNP2 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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