Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm3336J3QMQ6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm3336J3QMQ6 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Gm3336J3QMQ6 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Gm3336J3QMQ6 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm3336J3QMQ6 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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