Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms