Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ScaperF8VQ70 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms