Protein–RNA interactions for Protein: F7D8Y4

Gm17079, Predicted gene 17079 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17079F7D8Y4 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm17079F7D8Y4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms