Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Tnf-201ENSMUST00000025263 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Gm28038F7BCN9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Gm29013-201ENSMUST00000187431 237 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
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Gm28038F7BCN9 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Gm28038F7BCN9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Gm28038F7BCN9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Gm28038F7BCN9 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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Gm28038F7BCN9 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
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Gm28038F7BCN9 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Gm19445-201ENSMUST00000193649 2438 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm28038F7BCN9 Gm19212-201ENSMUST00000216642 862 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
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