Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm340F6RGI3 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
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