Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9S5

Gm9964, Predicted gene 9964, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9964E9Q9S5 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm9964E9Q9S5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm9964E9Q9S5 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Gm9964E9Q9S5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm9964E9Q9S5 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms