Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F6

Catsperd, Cation channel sperm-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperdE9Q9F6 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
CatsperdE9Q9F6 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
CatsperdE9Q9F6 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms