Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc85cE9Q6B2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc85cE9Q6B2 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms