Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms