Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Ighv5-1-201ENSMUST00000193324 353 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Map7-203ENSMUST00000213312 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Fxyd7-202ENSMUST00000206341 620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm15136-201ENSMUST00000120552 533 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Cbx3-ps5-201ENSMUST00000091545 544 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Cbx3-ps2-201ENSMUST00000099421 544 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Gcn1E9PVA8 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms